Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtpraP18052 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtpraP18052 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtpraP18052 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtpraP18052 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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