Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb7P09024 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms