Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp4O70480 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms