Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
CrxO54751 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CrxO54751 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms