Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EdaO54693 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EdaO54693 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
EdaO54693 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms