Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Sp100O35892 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Sp100O35892 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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Sp100O35892 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Sp100O35892 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Sp100O35892 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Sp100O35892 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Sp100O35892 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Sp100O35892 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Sp100O35892 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Sp100O35892 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sp100O35892 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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