Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2888K7N746 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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