Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm21976J3QNN2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21976J3QNN2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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