Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Nsdhl-201ENSMUST00000033715 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ttc39c-204ENSMUST00000169401 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Bfar-202ENSMUST00000069281 2456 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 I830077J02Rik-201ENSMUST00000098758 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm10608-201ENSMUST00000093527 2509 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms