Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms