Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Zfp988F6VKC7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Zfp988F6VKC7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Zfp988F6VKC7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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