Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx60E9PZQ1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms