Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms