Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Skint4A7TZF3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skint4A7TZF3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms