Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Palm3A2TJV2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms