Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm5538W4VSP6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm5538W4VSP6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm5538W4VSP6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm5538W4VSP6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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