Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms