Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms