Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ilf3Q9Z1X4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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