Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tusc2Q9WVF8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tusc2Q9WVF8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms