Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec2Q9WV35 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms