Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1a4Q9WV27 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp1a4Q9WV27 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1a4Q9WV27 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1a4Q9WV27 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp1a4Q9WV27 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms