Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXD3Q9UJU5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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FOXD3Q9UJU5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FOXD3Q9UJU5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXD3Q9UJU5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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