Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Snai3Q9QY31 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms