Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms