Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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