Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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