Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clstn1Q9EPL2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms