Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ift43Q9DA69 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms