Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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