Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Borcs6Q9D6W8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Borcs6Q9D6W8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Borcs6Q9D6W8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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