Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms