Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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