Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms