Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms