Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt84Q99M73 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt84Q99M73 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms