Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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