Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms