Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms