Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc6a20aQ8VDB9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Slc6a20aQ8VDB9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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