Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf1Q8CFK2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms