Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Hpf1Q8CFE2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Hpf1Q8CFE2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hpf1Q8CFE2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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