Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp27Q8CEG8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms