Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc187Q8C5V8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms