Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim47Q8C0E3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim47Q8C0E3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms