Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TtpaQ8BWP5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TtpaQ8BWP5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtpaQ8BWP5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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