Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms