Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6kb1Q8BSK8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms