Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjd4Q8BSD4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms