Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Liat1Q810M6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms